More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3223 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
122 aa  240  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  83.76 
 
 
120 aa  194  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  68.1 
 
 
126 aa  157  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  68.97 
 
 
125 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  68.97 
 
 
125 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  68.97 
 
 
125 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  57.52 
 
 
118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  58.49 
 
 
113 aa  130  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  51.67 
 
 
125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  59.8 
 
 
123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  53.85 
 
 
116 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  58.25 
 
 
183 aa  124  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  53.98 
 
 
119 aa  124  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.58 
 
 
115 aa  123  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  61.29 
 
 
123 aa  121  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  61.05 
 
 
127 aa  120  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  58.49 
 
 
120 aa  120  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  57.28 
 
 
112 aa  120  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  57.43 
 
 
125 aa  120  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  54.9 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  53.98 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  54.87 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  58.59 
 
 
120 aa  117  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 
123 aa  115  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  51.64 
 
 
124 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  51.35 
 
 
126 aa  113  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.65 
 
 
105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  56.04 
 
 
104 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 
125 aa  110  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  53.47 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  53 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  50.46 
 
 
127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  54.72 
 
 
137 aa  108  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  52.83 
 
 
129 aa  106  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  50.51 
 
 
116 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  55.43 
 
 
108 aa  105  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
136 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  49.55 
 
 
116 aa  101  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  52.17 
 
 
125 aa  99  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
126 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  45.63 
 
 
124 aa  99  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  55.13 
 
 
347 aa  98.2  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  43.81 
 
 
336 aa  97.1  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 
120 aa  96.7  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  54.88 
 
 
95 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  51.09 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  62.12 
 
 
349 aa  94.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  44.54 
 
 
337 aa  93.2  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  53.66 
 
 
109 aa  90.1  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  52.13 
 
 
124 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  42.72 
 
 
121 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  52.56 
 
 
337 aa  87.8  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 
121 aa  87.8  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  43.81 
 
 
117 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 
120 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
119 aa  84  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  41.75 
 
 
120 aa  84  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  41.75 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  45.98 
 
 
134 aa  80.1  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  40.82 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  49.44 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  42.06 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0727  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  43.27 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  52 
 
 
93 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  48.61 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  59.26 
 
 
68 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  48.65 
 
 
92 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  47.3 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  47.3 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  41.57 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  44.93 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
117 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  38.67 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  40 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  43.53 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  38.67 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  38.67 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  38.67 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  38.67 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  38.67 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  38.67 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  34.52 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>