More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6418 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 124 aa  249  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  68.1 
 
 		 125 aa  166  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  67.24 
 
 		 125 aa  164  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  66.38 
 
 		 120 aa  159  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  65.35 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  60.4 
 
 		 132 aa  140  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  56.6 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  55.1 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  55.34 
 
 		 116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  55.56 
 
 		 124 aa  115  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  52.88 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  59.77 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 123 aa  114  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  52.53 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  57.83 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 		 115 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  50.93 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  49 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 116 aa  107  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  54.26 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  51.52 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  47.66 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  44.55 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  50.54 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  53.41 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  52.44 
 
 		 183 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.26 
 
 		 105 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  56.96 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 109 aa  97.1  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  45.63 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  74.55 
 
 		 68 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  55.7 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  43.69 
 
 		 336 aa  93.6  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  47.42 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  48.1 
 
 		 349 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  48.1 
 
 		 347 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 337 aa  87  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  56 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 117 aa  87.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 		 337 aa  83.6  9e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  41.41 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  40.4 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  43.12 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 130 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 119 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  44.95 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  49.35 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  42.99 
 
 		 349 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  42.06 
 
 		 342 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 317 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  44.44 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  37.19 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  46.27 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 341 aa  71.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  48.05 
 
 		 328 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 341 aa  71.2  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  45.33 
 
 		 340 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>