More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0563 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 132 aa  262  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  79.17 
 
 		 136 aa  189  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  74.26 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  60.4 
 
 		 124 aa  140  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  69.7 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  55.75 
 
 		 125 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 125 aa  130  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  58.82 
 
 		 116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  58.82 
 
 		 125 aa  127  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  62.89 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 116 aa  128  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  58.76 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 120 aa  120  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  56.48 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  58.33 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  53.47 
 
 		 123 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  57.73 
 
 		 127 aa  117  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 127 aa  116  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  54.29 
 
 		 137 aa  116  9e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  58.33 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  52.78 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  52.13 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  50.51 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  83.08 
 
 		 68 aa  110  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  57.45 
 
 		 104 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 125 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  51.96 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  50.98 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  59.76 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.54 
 
 		 113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  54.55 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  53.47 
 
 		 122 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  62.03 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  52.63 
 
 		 183 aa  104  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  47.75 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  52.75 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  49.49 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  51.65 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  62.67 
 
 		 105 aa  98.6  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  48 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  48.08 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  45 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  43.86 
 
 		 336 aa  90.9  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 		 337 aa  89.4  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  46.6 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  48.81 
 
 		 347 aa  87.4  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  51.19 
 
 		 349 aa  87.4  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  42.57 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  43 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  46.99 
 
 		 337 aa  81.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  40.19 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  37.62 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  39.6 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  48.72 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  40.65 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  48.15 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 341 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  48.68 
 
 		 340 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5044  ArsR family transcriptional regulator  68.09 
 
 		 56 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18118 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  46.88 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  45.31 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  45.31 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  45.31 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  45.31 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  45.31 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  45.31 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  43.21 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  45.31 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  47.95 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  45.31 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  48.53 
 
 		 342 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  48.53 
 
 		 349 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  48.53 
 
 		 354 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>