More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2532 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
122 aa  252  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  46.07 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  41.11 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  43.53 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  50.7 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  50.7 
 
 
347 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  43.59 
 
 
95 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  36.63 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
120 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  37.65 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  35.16 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
124 aa  67  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  46.48 
 
 
336 aa  67.4  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  44.29 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  36.08 
 
 
102 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  41.49 
 
 
102 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  34.95 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  36.46 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 
337 aa  65.5  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1200  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 
337 aa  65.5  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  42.67 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  43.24 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 
100 aa  63.9  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  34.78 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  34.44 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  31.46 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
100 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
100 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  34.78 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  35.42 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  35.71 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  34.02 
 
 
100 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 
112 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
118 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  42.05 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0211  arsenical resistance operon repressor  34.83 
 
 
105 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  39.58 
 
 
95 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
100 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  44.29 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>