More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0960 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 100 aa  208  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  99 
 
 		 100 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  98 
 
 		 100 aa  203  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  90 
 
 		 100 aa  190  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  79 
 
 		 100 aa  166  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  77 
 
 		 104 aa  165  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  76 
 
 		 104 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  78.35 
 
 		 100 aa  155  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  68 
 
 		 100 aa  147  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  68 
 
 		 100 aa  147  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  71.13 
 
 		 102 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  68.63 
 
 		 102 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  68.63 
 
 		 102 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  68.63 
 
 		 102 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 102 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  67.35 
 
 		 106 aa  138  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  64 
 
 		 100 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  63.27 
 
 		 97 aa  131  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  65.31 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  63 
 
 		 100 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  62.24 
 
 		 97 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  62.38 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  65.22 
 
 		 95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  63.37 
 
 		 101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  63.37 
 
 		 101 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  63.37 
 
 		 101 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  63.37 
 
 		 101 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  63.37 
 
 		 101 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  63.37 
 
 		 101 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  63.37 
 
 		 101 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  63.27 
 
 		 109 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  61.7 
 
 		 96 aa  124  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  59.57 
 
 		 102 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  62.35 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  62.35 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  51.49 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  53.19 
 
 		 100 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  49.43 
 
 		 100 aa  97.1  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 90 aa  95.9  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  47.73 
 
 		 100 aa  94.7  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6888  ArsR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 100 aa  93.6  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231316  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  48.42 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 100 aa  92  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  46.32 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1732  regulatory protein, ArsR  47.42 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  39.8 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  43.62 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  39.58 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.89 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1845  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 100 aa  67  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 99 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  35.11 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  35.06 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  35.06 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  34.18 
 
 		 116 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 98 aa  48.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1708  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00199719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  36.25 
 
 		 135 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  33.96 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  34.18 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 350 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  36.71 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  31.63 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1200  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  32.58 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  32.93 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  39.62 
 
 		 309 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  28.41 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  28.41 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  34.12 
 
 		 266 aa  47  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>