126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1476 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 130 aa  269  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  48.54 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 100 aa  93.6  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  47 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  44.23 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  42.72 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 100 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  43 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 100 aa  84  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  39.05 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.75 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  42.42 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 100 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 100 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 102 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  37.86 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  37.86 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 100 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  40.78 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  39.22 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  39.22 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  36.89 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  40.62 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  41.41 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  38.38 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  38.38 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6888  ArsR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 99 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 99 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 99 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1845  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1732  regulatory protein, ArsR  35.24 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44825  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  26.5 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  30.93 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  31.31 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 125 aa  43.5  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  29.55 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  26.32 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  27 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  31.31 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  28.81 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  28.44 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  29.9 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.26 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  26.53 
 
 		 89 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3372  regulatory protein, ArsR  29.91 
 
 		 106 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  25.44 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  26.4 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>