160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2484 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 101 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  87.13 
 
 		 101 aa  187  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  96.67 
 
 		 90 aa  183  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  51.49 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  57 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  52.58 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 100 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  50.5 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 100 aa  105  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  60.64 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 102 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  47.52 
 
 		 100 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  47.52 
 
 		 100 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 102 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 102 aa  103  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 100 aa  103  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.68 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 165 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  55.17 
 
 		 100 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 97 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 101 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 101 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 100 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 101 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 101 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 101 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 101 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  47.47 
 
 		 100 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  46.53 
 
 		 100 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  51.09 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 106 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  51.58 
 
 		 96 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  48.42 
 
 		 98 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  47.92 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  47.96 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  46.32 
 
 		 102 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.44 
 
 		 100 aa  91.3  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 109 aa  90.1  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  44.79 
 
 		 99 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  45.16 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  46.74 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.07 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 102 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  43.75 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1845  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6888  ArsR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1732  regulatory protein, ArsR  43.88 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44825  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  33.71 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  33.96 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 337 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2879  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  35.96 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  37.65 
 
 		 287 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  29.03 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  33.33 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  37.36 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  38.75 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  38.75 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  32.93 
 
 		 336 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>