More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3338 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 100 aa  204  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  92 
 
 		 100 aa  191  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  86 
 
 		 100 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  86 
 
 		 100 aa  178  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  58 
 
 		 100 aa  125  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  55 
 
 		 100 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  57 
 
 		 100 aa  116  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  59 
 
 		 101 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  55 
 
 		 100 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  57 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 		 100 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  52.53 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  51.02 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  51.96 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 100 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 102 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  51 
 
 		 100 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  51 
 
 		 100 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 100 aa  103  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  49 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  53 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  53 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  53 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  53 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 		 102 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 		 102 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  48.91 
 
 		 100 aa  97.8  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 102 aa  97.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  47 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  50.52 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  49 
 
 		 100 aa  94.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  43.69 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 		 117 aa  92.8  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  44.79 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  45.26 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 100 aa  84.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1845  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1732  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44825  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6888  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  31.58 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  31.63 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  38.38 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  32.97 
 
 		 125 aa  52  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 122 aa  50.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>