297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2780 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  204  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.35 
 
 
100 aa  107  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  56.25 
 
 
100 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  56.47 
 
 
100 aa  104  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  50.98 
 
 
106 aa  100  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  48.35 
 
 
165 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  55.81 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  46.15 
 
 
101 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
100 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  53.41 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
101 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 
101 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 
100 aa  88.6  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
102 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
100 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  47.25 
 
 
100 aa  89  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
102 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 
106 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
102 aa  87  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
102 aa  87  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  47.87 
 
 
100 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
102 aa  87  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
100 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  43.16 
 
 
100 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  47.37 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  43.16 
 
 
100 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  55 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  55 
 
 
127 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
100 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  45.26 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  43.96 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
100 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  39.58 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
100 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  43.01 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1845  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  39.36 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 
98 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
100 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
99 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
99 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6888  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231316  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
137 aa  60.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
122 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1732  regulatory protein, ArsR  39.33 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44825  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 
105 aa  53.5  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
104 aa  52  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
115 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
98 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  30.11 
 
 
119 aa  51.2  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  35.11 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
132 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  28.57 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0550  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  35.96 
 
 
120 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  32.14 
 
 
89 aa  50.1  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  33.68 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1200  transcriptional regulator, ArsR family  30.11 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  35.96 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1931  transcriptional regulator, ArsR family  34 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  31.87 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  31.87 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  31.87 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>