133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1336 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 98 aa  204  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  96.94 
 
 		 102 aa  199  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  46.39 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  53.06 
 
 		 100 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 100 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  48.98 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 100 aa  103  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 100 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  46.39 
 
 		 100 aa  102  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 102 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  50.54 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  47.37 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 101 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 100 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 100 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 99 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  48.42 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  42.71 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 99 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 165 aa  90.5  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 101 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  47.31 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 		 97 aa  90.1  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  46.39 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  46.39 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  46.32 
 
 		 100 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 97 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 106 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.91 
 
 		 100 aa  86.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  43.96 
 
 		 100 aa  86.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  44.83 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 100 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  43.68 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  40.86 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  39.36 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1845  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6888  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1732  regulatory protein, ArsR  40.62 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44825  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 317 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2994  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1527  regulatory protein ArsR  32.65 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0617879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  38.33 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  27.78 
 
 		 183 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0666  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  30.34 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  38.2 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  37.29 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  30.34 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  38.6 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  35.06 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  35.59 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  30.34 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  30.26 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  42.59 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>