More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1845 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1845  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 116 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 100 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  41.84 
 
 		 100 aa  84.7  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 99 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 99 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 99 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  45.26 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  40.82 
 
 		 100 aa  80.1  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  41.3 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  48.05 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  40.43 
 
 		 104 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  43.48 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  41.05 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  39.77 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  40.51 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  43.04 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  50.65 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  39.24 
 
 		 100 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  39.24 
 
 		 100 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  33.65 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  33.65 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  33.65 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  33.65 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  36.79 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  33.65 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  30.36 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  33.65 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  32.69 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  32.69 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  45.16 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  32.69 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  29.63 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>