91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06305 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  100 
 
 
100 aa  209  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  59.52 
 
 
100 aa  107  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.54 
 
 
100 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  56.38 
 
 
103 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  57.45 
 
 
103 aa  101  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 
106 aa  100  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  49.44 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  47.87 
 
 
165 aa  97.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 
100 aa  96.7  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  49.44 
 
 
100 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  48.91 
 
 
100 aa  96.7  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  49.44 
 
 
100 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  48.35 
 
 
102 aa  93.6  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 
100 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  48.35 
 
 
102 aa  92  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  48.35 
 
 
102 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  48.35 
 
 
102 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  48.35 
 
 
102 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  48.35 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  48.35 
 
 
102 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  45.65 
 
 
100 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  47.83 
 
 
100 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  47.83 
 
 
100 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  46.46 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  47.25 
 
 
99 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  43.96 
 
 
102 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
100 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
106 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  43.96 
 
 
98 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  40.43 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  43.62 
 
 
100 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
100 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.31 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 
104 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 
97 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
100 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  45.98 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  43.33 
 
 
95 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
109 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  46.59 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  43.62 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 
130 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  46.99 
 
 
102 aa  73.6  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1845  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 
116 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
99 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
99 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
99 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6888  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
100 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231316  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
100 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
115 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1732  regulatory protein, ArsR  36.67 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44825  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 
110 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  34.21 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 
117 aa  43.5  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2879  ArsR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  26.97 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  29.73 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  27.16 
 
 
131 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  28.89 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  25.56 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  26.88 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6202  putative transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 
277 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0373742  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  26.14 
 
 
112 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  30.26 
 
 
127 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>