More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03333 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 113 aa  231  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  53 
 
 		 115 aa  120  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  52.63 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  52 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 		 258 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  47.52 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  46.53 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 		 118 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  51.46 
 
 		 116 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 115 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  48.11 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  49 
 
 		 118 aa  110  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  51.89 
 
 		 140 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  56.47 
 
 		 114 aa  110  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1608  transcriptional regulator, ArsR family  49.48 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 114 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  46.53 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  47.62 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  49.06 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.37 
 
 		 305 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  50.52 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  45.28 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  47 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  49.06 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  49.06 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  45 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  49.06 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  45 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  48.11 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  48.11 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 275 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  48.11 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  56.47 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  48.11 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  56.47 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  48.11 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  56.47 
 
 		 113 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 		 117 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 114 aa  103  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  47 
 
 		 115 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  50.57 
 
 		 111 aa  100  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  49.43 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  51.72 
 
 		 111 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  48.89 
 
 		 270 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530376 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  44.12 
 
 		 117 aa  95.9  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1483  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  50.6 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  41.18 
 
 		 248 aa  85.9  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  47.89 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1112  regulatory protein, ArsR  47.78 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  45.35 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  52.31 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  44.59 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  51.47 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1386  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  40.24 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  40.24 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1075  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000458748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  50.72 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  50.77 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 337 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  40.28 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 127 aa  67  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 115 aa  67  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1390  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000534285  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  44.29 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>