More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1732 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1732  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 115 aa  231  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44825  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  55.21 
 
 		 95 aa  114  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.64 
 
 		 97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  55.79 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  51.85 
 
 		 100 aa  110  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.61 
 
 		 97 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  54.64 
 
 		 100 aa  110  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  50.52 
 
 		 100 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  50.52 
 
 		 100 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  48 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 100 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 117 aa  103  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 100 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  55.91 
 
 		 102 aa  103  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  51.38 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  51.38 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 100 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 100 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  50.46 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  50.46 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  50.46 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  50.46 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  47.42 
 
 		 100 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  50.46 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  50.46 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  59.76 
 
 		 102 aa  100  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  59.76 
 
 		 127 aa  100  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  41.84 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  41.76 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  42.39 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  43.53 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  40.62 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  39.33 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.24 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  36.67 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 100 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6888  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  40.66 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1845  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 102 aa  52.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  32.69 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  32.35 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  37.93 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  37.93 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2619  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  30.39 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  33.67 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  32.22 
 
 		 98 aa  48.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  31.07 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  31.25 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>