More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3726 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  52.22 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  45.56 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  52.22 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  49.02 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  49.53 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  48.35 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  43.56 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 107 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  50 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  46.53 
 
 		 121 aa  84.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  45.92 
 
 		 227 aa  84.3  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  46.81 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  48.6 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  45.54 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  47.78 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  46.59 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  46.43 
 
 		 87 aa  80.5  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 98 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  44.21 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  43.16 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  46.99 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  41.41 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  44.57 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  44.57 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  44.57 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  45.78 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  44.57 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  44.57 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  45.35 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  45.65 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  43.48 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  45.05 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4378  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0649635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2472  ArsR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 		 116 aa  76.6  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4967  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1206  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233915  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  44.05 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  44.19 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4262  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2752  transcriptional regulator, TrmB  49.37 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1145  regulatory protein ArsR  51.85 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  40.4 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  44.19 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  41.11 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  46.05 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3418  ArsR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00835555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3220  ArsR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  40.86 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  42.22 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  46.07 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  40.62 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0923  transcriptional regulator, TrmB  47.31 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  42.27 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1304  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  40.19 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>