More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1206 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1206  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  232  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233915  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  51.11 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  51.11 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  51.11 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  51.11 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  48.89 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  44.44 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  45.56 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  49.4 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  46.53 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  46.99 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 102 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 102 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  46.67 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  46.43 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  46.67 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  45.56 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  45.56 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  45.56 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  43.96 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  43.59 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  39.58 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  47.42 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  41.49 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  41.49 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  37.76 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  41.49 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  41.49 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  41.18 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  41.11 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  38.14 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  40.43 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  41.11 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1742  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11027 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  39.18 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  39.56 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 101 aa  67  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2472  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2275  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  40.45 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  38.3 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  43.53 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  36.67 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  39.08 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  39.53 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  41.86 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 115 aa  62  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  40.4 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4102  transcriptional regulator ArsR family  40.96 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00250446  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>