More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5804 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 100 aa  208  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  89 
 
 		 100 aa  189  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 109 aa  150  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  69.39 
 
 		 117 aa  146  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  69.39 
 
 		 102 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  72.16 
 
 		 102 aa  143  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  68.37 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  68.37 
 
 		 102 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  68.37 
 
 		 102 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  68.37 
 
 		 102 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  67.35 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  66 
 
 		 100 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  67.35 
 
 		 106 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 101 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 101 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 101 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 101 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 101 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 101 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  66 
 
 		 100 aa  133  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  63 
 
 		 100 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  63 
 
 		 100 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  63 
 
 		 100 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  63 
 
 		 100 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  62 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  60 
 
 		 104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  65.96 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  62.5 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  60.64 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  57.29 
 
 		 102 aa  120  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  58.16 
 
 		 97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 		 97 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  46.53 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 101 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1732  regulatory protein, ArsR  51.85 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 		 100 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 100 aa  92  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  49 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  46.32 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 100 aa  87.8  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  39.8 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 103 aa  87  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  46.67 
 
 		 100 aa  86.7  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.78 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6888  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231316  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  42.86 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  43.75 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  42.11 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1845  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.65 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  37.63 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  40.7 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 103 aa  52  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  34.15 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 87 aa  48.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  38.55 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  34.12 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  37.35 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>