More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1705 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  233  5.0000000000000005e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  49.54 
 
 		 135 aa  120  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1931  transcriptional regulator, ArsR family  44.14 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0755  transcriptional regulator, ArsR family  42.73 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.554367  normal  0.0268545 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  47.22 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 317 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  42.06 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  41.75 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  36.61 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  38.61 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  38.61 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  49.3 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  42.17 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  39.45 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1264  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00305286  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  39.45 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  44.93 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  45.33 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0706  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  44.93 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  45.71 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  52.24 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  44.93 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  33.67 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  47.89 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  52.31 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  39.24 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  42.86 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 258 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  42.25 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 97 aa  67  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 114 aa  67  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  50 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  49.25 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  42.25 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  39.76 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  40.26 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  41.89 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.25 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  49.25 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  41.1 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  31.19 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  48.48 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  47.76 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  47.76 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  47.76 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  47.76 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  47.76 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  40 
 
 		 336 aa  64.3  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>