More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_876 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 112 aa  233  6e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  79.46 
 
 		 112 aa  187  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  78.38 
 
 		 112 aa  183  6e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  36.61 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1931  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  39.64 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  43.97 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  47.89 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  46.27 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  39.64 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0755  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.554367  normal  0.0268545 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  48.53 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  42.47 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 324 aa  63.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  38.18 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  40.26 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  52.31 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  43.28 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  41.79 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  41.54 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 348 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  44.62 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  31.3 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  43.08 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  45.31 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  43.24 
 
 		 307 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  42.67 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  43.94 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  40.96 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  46.58 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  41.79 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  46.58 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  46.58 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  47.76 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1731  arsenical resistance operon repressor  38.89 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0861085  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  36.25 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  42.55 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0459  transcriptional regulator, ArsR family  35.34 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83445  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  36.25 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0666  transcriptional regulator, ArsR family  31.53 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  36.25 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  48.48 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  35.56 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  36.36 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  43.48 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>