More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3390 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  238  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  62.28 
 
 		 114 aa  149  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  58.04 
 
 		 134 aa  144  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 317 aa  93.6  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  34.82 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0936  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00366082  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  41.77 
 
 		 94 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  45.35 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  41.77 
 
 		 94 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  44.05 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  47.76 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0666  transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  47.22 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  40.48 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  47.69 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  47.69 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  33.63 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  33.63 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 116 aa  67  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1731  arsenical resistance operon repressor  38.89 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0861085  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  39.39 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  42.42 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  32.71 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  42.67 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  36.14 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  36.14 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  36.14 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  34.21 
 
 		 336 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  40.91 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  40 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1264  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00305286  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  39.76 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  44.12 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  38.38 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  41.54 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  42.65 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 349 aa  63.5  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  36 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  38.82 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  44.12 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  41.79 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  40.66 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  44.12 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  31.36 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  40.51 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>