More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0576 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 108 aa  219  9e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0936  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00366082  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  55.56 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  53.52 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  53.52 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  50.77 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  45.57 
 
 		 115 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  45.57 
 
 		 115 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  45.57 
 
 		 115 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  49.23 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  43.9 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  49.28 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1731  arsenical resistance operon repressor  42.05 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0861085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  39.36 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  47.76 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  47.06 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  47.06 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  33.67 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  42.25 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  34.07 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  45.59 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  37.18 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  38.64 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1527  regulatory protein ArsR  38.04 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0617879  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  34.65 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  43.24 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  34.67 
 
 		 95 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  40.51 
 
 		 92 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  37.8 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  41.43 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  44.29 
 
 		 94 aa  67  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.27 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  44.78 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.78 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0666  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.78 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.78 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  44.78 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  36.05 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.78 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  38.24 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  41.79 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>