More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0532 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  100 
 
 		 114 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  91.23 
 
 		 114 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  91.23 
 
 		 114 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  90.35 
 
 		 114 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  89.47 
 
 		 114 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  83.33 
 
 		 114 aa  201  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  82.46 
 
 		 114 aa  201  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  81.58 
 
 		 114 aa  197  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  67.54 
 
 		 115 aa  169  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  67.54 
 
 		 115 aa  169  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  67.54 
 
 		 115 aa  169  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  65.79 
 
 		 116 aa  157  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 114 aa  148  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  62.28 
 
 		 115 aa  143  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  58.77 
 
 		 114 aa  143  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  58.93 
 
 		 116 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  54.39 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  54.39 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 115 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 275 aa  127  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  52.63 
 
 		 270 aa  122  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  50.88 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  51.75 
 
 		 305 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 258 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  50.88 
 
 		 133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  51.33 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  49.12 
 
 		 115 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  55.26 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  52.38 
 
 		 134 aa  114  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.86 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  59.76 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 113 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  47 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  48.18 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  56.1 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  54.88 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  45.54 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  47.06 
 
 		 106 aa  99.4  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50.59 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50.59 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1608  transcriptional regulator, ArsR family  51.16 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530376 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  48.04 
 
 		 117 aa  97.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.25 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.25 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.36 
 
 		 117 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.36 
 
 		 117 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  43.36 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  43.36 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  43.36 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.36 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.53 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  51.22 
 
 		 140 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  51.85 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1483  ArsR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1112  regulatory protein, ArsR  47.22 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  60.29 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  49 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  45.12 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  53.42 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  50.63 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1386  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  50.7 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1075  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000458748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  52.05 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4077  transcriptional regulator, ArsR family  52.11 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  41.12 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2952  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  50.7 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  45.57 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  50.7 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0522  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  47.62 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  52.94 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0666  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 317 aa  68.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  44.16 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1527  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0617879  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  47.69 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>