More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3077 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  93.91 
 
 		 145 aa  226  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  93.91 
 
 		 115 aa  225  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  75.65 
 
 		 116 aa  181  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  71.3 
 
 		 115 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  64.04 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  62.28 
 
 		 118 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  62.28 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  61.06 
 
 		 118 aa  141  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  60.55 
 
 		 115 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  56.14 
 
 		 114 aa  137  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  55.65 
 
 		 116 aa  134  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 114 aa  133  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 114 aa  133  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  59.29 
 
 		 258 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  57.02 
 
 		 114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  56.88 
 
 		 114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  54.39 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  53.51 
 
 		 114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  53.51 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  54.39 
 
 		 114 aa  127  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  53.04 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  53.04 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.99 
 
 		 117 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  58.33 
 
 		 117 aa  110  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  59.04 
 
 		 117 aa  110  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  59.04 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  59.04 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  59.04 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  59.04 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  59.04 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  59.04 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  57.14 
 
 		 140 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  57.14 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  47.37 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  57.65 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  57.65 
 
 		 113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  57.65 
 
 		 113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  50.47 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  48.25 
 
 		 111 aa  107  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  57.47 
 
 		 111 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 113 aa  106  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  53.21 
 
 		 117 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  56.32 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.22 
 
 		 305 aa  104  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.08 
 
 		 106 aa  103  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 275 aa  101  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1608  transcriptional regulator, ArsR family  52.53 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530376 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.59 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  42.98 
 
 		 270 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1112  regulatory protein, ArsR  46.49 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202553  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1483  ArsR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  40.59 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  47 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  47.89 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  42.05 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  39.29 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  49.3 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  49.3 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0522  ArsR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1075  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000458748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1532  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 306 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 317 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  40.91 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1386  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  35.92 
 
 		 336 aa  67.4  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  48.53 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  39.77 
 
 		 99 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  48.53 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  36.04 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  48.53 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1502  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000371011  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>