More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3637 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  100 
 
 		 115 aa  242  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 115 aa  124  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  52.63 
 
 		 115 aa  124  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  52.68 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  50.88 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  51.75 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  49.56 
 
 		 116 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 115 aa  116  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  50.88 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  49.12 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  44.74 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  47.37 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  46.49 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 258 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  43.86 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  43.36 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  47 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 275 aa  99.8  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.95 
 
 		 305 aa  98.2  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  46.79 
 
 		 270 aa  98.2  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  42.61 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  42.16 
 
 		 134 aa  93.2  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1608  transcriptional regulator, ArsR family  51.76 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  51.81 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  51.9 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  55.7 
 
 		 117 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  55.7 
 
 		 117 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  56.41 
 
 		 117 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  56.41 
 
 		 117 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  56.41 
 
 		 117 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  56.41 
 
 		 117 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  56.41 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  56.41 
 
 		 117 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  56.41 
 
 		 117 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  51.9 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  44.74 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  51.22 
 
 		 111 aa  88.2  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  47.06 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  47.06 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  47.06 
 
 		 113 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  44.58 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.3 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  39.6 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.77 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1483  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530376 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  39.02 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  40.45 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0706  ArsR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  47.14 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1112  regulatory protein, ArsR  40.24 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202553  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4077  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1075  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000458748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  46.48 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1532  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1386  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  36.78 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  43.53 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  43.53 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  43.53 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  34.09 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  39.08 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  48.57 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  38.27 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 317 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>