More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3415 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  100 
 
 		 113 aa  232  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  98.23 
 
 		 113 aa  228  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  98.23 
 
 		 113 aa  228  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  65.49 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  73.2 
 
 		 110 aa  154  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  60.68 
 
 		 117 aa  149  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  59.83 
 
 		 117 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  58.97 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  58.97 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  59.83 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  58.97 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  59.83 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  58.97 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  61.06 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  63.44 
 
 		 106 aa  133  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  60.22 
 
 		 106 aa  130  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 115 aa  120  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  53.98 
 
 		 114 aa  120  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.64 
 
 		 117 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  57.65 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  57.65 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  56.04 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  56.47 
 
 		 145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  56.47 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  48.7 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  54.44 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 258 aa  104  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  56.47 
 
 		 113 aa  104  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 114 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  47.52 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  52.94 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  52.94 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 118 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  51.76 
 
 		 115 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  51.69 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  51.76 
 
 		 115 aa  100  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 115 aa  100  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  45.54 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  47.06 
 
 		 111 aa  97.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  50.6 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  53.57 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  53.01 
 
 		 109 aa  96.7  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 114 aa  94  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 275 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  49.43 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  44.19 
 
 		 270 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1608  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530376 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  47.06 
 
 		 248 aa  87.8  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.51 
 
 		 305 aa  87.8  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1483  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 135 aa  84.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1112  regulatory protein, ArsR  53.57 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202553  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  47.06 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  52.7 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  44.3 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  42.53 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  48.86 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  49.28 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1386  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  46.84 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1075  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000458748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  43.21 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  40.86 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  41.43 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 317 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  52.24 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  45.83 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  47.76 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4077  transcriptional regulator, ArsR family  49.23 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  40.66 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0936  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00366082  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>