More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2033 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 131 aa  268  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4286  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.3 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  41.3 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40.86 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  41.56 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.3 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  52.24 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.3 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.39 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.39 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  41.3 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.3 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.39 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  41.77 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40.86 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.13 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  52.24 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40.86 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  52.24 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  51.35 
 
 		 173 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  36.26 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0487  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  47.3 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  38.61 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  36.89 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  36.04 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  44.3 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 323 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5816  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  52.31 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  49.25 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 102 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  36.44 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  49.25 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  37.63 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  35.79 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  49.25 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  37.97 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50.77 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  47.14 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  38.96 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  39.71 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  42.57 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 106 aa  62  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  35.24 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  49.23 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  40.51 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  42.5 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  36.23 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  36.67 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  46.25 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  39.36 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  47.76 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  46.88 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>