More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0586 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 113 aa  233  7e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  68.75 
 
 		 111 aa  163  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  66.07 
 
 		 111 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  66.07 
 
 		 109 aa  159  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  53.7 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  49.14 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 115 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 115 aa  114  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  51.75 
 
 		 115 aa  114  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  51.75 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  49.54 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  49.54 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 114 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  49.54 
 
 		 114 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 114 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  50.46 
 
 		 258 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 115 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  49.12 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  48.28 
 
 		 114 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  48.6 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  50.93 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 115 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  47.66 
 
 		 145 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.13 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  50.45 
 
 		 115 aa  100  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  46.73 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530376 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 110 aa  98.2  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  53.01 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  53.01 
 
 		 117 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  53.66 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  53.66 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  53.66 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  53.66 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  53.66 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  53.66 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  53.66 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 275 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  47.13 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50.6 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.12 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.12 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  46.91 
 
 		 248 aa  90.5  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.99 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.3 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  50.65 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1608  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  38.61 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.45 
 
 		 305 aa  86.3  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  41.44 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  40.37 
 
 		 270 aa  85.1  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  44.94 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1112  regulatory protein, ArsR  43.52 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202553  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1075  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000458748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1386  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1483  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 112 aa  67  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  35.14 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  46.97 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  45.07 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 339 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 		 342 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  42.67 
 
 		 349 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 		 354 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4077  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0169  transcription regulator ArsR family protein  40.3 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.537657  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  47.06 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0293  transcription regulator ArsR family protein  40.3 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  41.79 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 309 aa  60.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 317 aa  60.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 328 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  34.94 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  40 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>