More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1658 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
183 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  64.04 
 
 
123 aa  142  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  63.54 
 
 
125 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  56.52 
 
 
125 aa  129  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.73 
 
 
113 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  59.79 
 
 
119 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  69.51 
 
 
112 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  62.92 
 
 
123 aa  121  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  61.54 
 
 
115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  65.17 
 
 
120 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  69.62 
 
 
120 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  58.25 
 
 
122 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  60.61 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  62.22 
 
 
118 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 
127 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  59.78 
 
 
104 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  58.95 
 
 
116 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  69.23 
 
 
105 aa  117  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  59.34 
 
 
124 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  55.34 
 
 
120 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  61.05 
 
 
116 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
125 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
125 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
125 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  54.46 
 
 
123 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  59.34 
 
 
126 aa  114  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  55.21 
 
 
137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  53.15 
 
 
126 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  56.04 
 
 
336 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  59.76 
 
 
125 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  58.54 
 
 
127 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  58.54 
 
 
125 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 
132 aa  104  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  48.18 
 
 
131 aa  104  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  49.04 
 
 
125 aa  104  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  58.23 
 
 
347 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  58.02 
 
 
129 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  54.35 
 
 
127 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  51.09 
 
 
127 aa  101  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  50.53 
 
 
116 aa  100  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  59.49 
 
 
116 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  52.44 
 
 
124 aa  99.8  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  65.15 
 
 
349 aa  99.4  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 
117 aa  99.4  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  53.66 
 
 
136 aa  98.2  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  54.65 
 
 
95 aa  97.4  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  63.24 
 
 
337 aa  97.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  55.42 
 
 
108 aa  97.1  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  48.84 
 
 
120 aa  95.5  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  48.42 
 
 
127 aa  95.5  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  52.44 
 
 
120 aa  93.2  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  53.16 
 
 
337 aa  91.7  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  55.56 
 
 
124 aa  89.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  53.25 
 
 
109 aa  89  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  53.66 
 
 
120 aa  86.3  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  42.27 
 
 
120 aa  84.7  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  42.27 
 
 
120 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 
121 aa  83.6  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  48.19 
 
 
119 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 
121 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  48.31 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  39.17 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  48.31 
 
 
130 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  48.31 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
119 aa  79  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  48 
 
 
117 aa  77  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
132 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  49.37 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.86 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
97 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  45.65 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  51.32 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  35.16 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1527  regulatory protein ArsR  44 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0617879  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  42.5 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  35.16 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  50.72 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1433  ArsR family transcriptional regulator  49.35 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.662802 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
95 aa  74.7  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  39.74 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 
103 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  52.73 
 
 
68 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  44.29 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  43.18 
 
 
120 aa  73.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  45.57 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 
115 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  47.56 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  43.28 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 
117 aa  72  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  43.28 
 
 
94 aa  72  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  49.28 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  46.97 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
97 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
114 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>