More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3175 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
126 aa  254  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  90.48 
 
 
126 aa  228  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  59.68 
 
 
123 aa  143  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  59.06 
 
 
124 aa  139  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  63.55 
 
 
119 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  56.56 
 
 
125 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  61.68 
 
 
127 aa  134  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  64 
 
 
112 aa  133  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  61.76 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  62.75 
 
 
125 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  58.25 
 
 
123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  55.37 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  71.08 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  58 
 
 
123 aa  122  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  64.71 
 
 
115 aa  120  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.56 
 
 
113 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  58.16 
 
 
104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  60.44 
 
 
183 aa  117  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  50.89 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  54.35 
 
 
120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  50.89 
 
 
120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  60 
 
 
120 aa  107  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  65.79 
 
 
105 aa  107  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
131 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  47.41 
 
 
117 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 
127 aa  102  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 
116 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
125 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  52.04 
 
 
127 aa  101  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  54.12 
 
 
127 aa  100  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  53.06 
 
 
120 aa  100  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
116 aa  100  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  52 
 
 
125 aa  99.8  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 
127 aa  99.4  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 
125 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 
125 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 
126 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 
125 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 
125 aa  97.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  52.87 
 
 
95 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  48.28 
 
 
336 aa  97.4  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 
132 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  46.36 
 
 
136 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  47.17 
 
 
124 aa  97.1  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
129 aa  96.7  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  51.28 
 
 
349 aa  95.9  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
119 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  51.28 
 
 
347 aa  94.4  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
119 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
130 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  51 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  52.56 
 
 
337 aa  90.9  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  48.39 
 
 
108 aa  90.9  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 
337 aa  88.6  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 
120 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  41.88 
 
 
135 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  47.13 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  47.13 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  42.74 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  51.72 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  40.38 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  51.16 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  41.41 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  40.38 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  45.16 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 
114 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  54.69 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.81 
 
 
93 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  43.28 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  43.28 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.31 
 
 
117 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  39.74 
 
 
101 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  44.29 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  44.29 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
101 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  39.74 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  39.74 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  39.74 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  39.74 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  39.74 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  39.74 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.35 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  47.06 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  43.94 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>