More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0822 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 118 aa  245  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  52.04 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  48.42 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  45.74 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  42 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  46.81 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  42.2 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  39.25 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  43.96 
 
 		 109 aa  76.6  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  48.1 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 337 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.68 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  46.99 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  35.51 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  38.32 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  35.85 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1200  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  37.63 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  44.57 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  33.33 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  37.78 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 349 aa  71.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 347 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  42.31 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  41.11 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  33.72 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  34.65 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  41.56 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  39.08 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  34.55 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  34.65 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  32.98 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  34.58 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  34.48 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  43.24 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  32.77 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  34.65 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>