More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0571 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
100 aa  207  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  58 
 
 
100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  58 
 
 
100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  58 
 
 
100 aa  127  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  60.87 
 
 
100 aa  126  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  55 
 
 
100 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  58.42 
 
 
100 aa  121  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  56 
 
 
100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  56.7 
 
 
106 aa  107  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  49.51 
 
 
103 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  48.98 
 
 
98 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  48.54 
 
 
103 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  56.25 
 
 
99 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  51 
 
 
97 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  52.08 
 
 
101 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
97 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  46 
 
 
100 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 
100 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 
100 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 
100 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  48.39 
 
 
100 aa  96.7  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  51.09 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 
100 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.54 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  48.91 
 
 
100 aa  96.7  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
104 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  51.72 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 
99 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 
99 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 
99 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
117 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 
102 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 
102 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 
102 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 
102 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 
102 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  52.58 
 
 
102 aa  93.6  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 
99 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  43 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1845  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 
116 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  43 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  43 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 
99 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  44.33 
 
 
96 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 
102 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
100 aa  90.5  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  55.17 
 
 
102 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 
106 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 
100 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  56.63 
 
 
127 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  45.83 
 
 
95 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 
100 aa  84.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6888  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
100 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231316  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  32.32 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 
117 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  37.76 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 
108 aa  60.8  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1732  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44825  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  32.18 
 
 
117 aa  57.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
121 aa  57  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1708  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00199719  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  30.93 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1729  ArsR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.618601  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  32.63 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  30.93 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  38.46 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
114 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  34.74 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  34.07 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  34.69 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  30 
 
 
183 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  31.58 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  32.61 
 
 
107 aa  55.1  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>