More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2723 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
97 aa  207  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  96.91 
 
 
97 aa  202  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  75.27 
 
 
96 aa  161  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  65.96 
 
 
95 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  68.37 
 
 
100 aa  143  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  68.37 
 
 
100 aa  143  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  68.13 
 
 
102 aa  140  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  67.35 
 
 
100 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  68.37 
 
 
106 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  63.27 
 
 
100 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  64.29 
 
 
100 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  64.29 
 
 
100 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  62.24 
 
 
104 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  63.27 
 
 
100 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  66.67 
 
 
100 aa  131  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  61.22 
 
 
104 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  61.22 
 
 
117 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  61.22 
 
 
102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  70.37 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  70.37 
 
 
102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  61.22 
 
 
102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  61.22 
 
 
102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  61.22 
 
 
102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  63.92 
 
 
102 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  60.2 
 
 
102 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  60.2 
 
 
102 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  61.22 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  62.63 
 
 
101 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  62.63 
 
 
101 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  62.63 
 
 
101 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  62.63 
 
 
101 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  62.63 
 
 
101 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  62.63 
 
 
101 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  62.63 
 
 
101 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  59.18 
 
 
100 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  61.62 
 
 
165 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  58.16 
 
 
100 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  54.55 
 
 
101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  51 
 
 
100 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  53.68 
 
 
101 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  52.22 
 
 
100 aa  100  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 
100 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
100 aa  98.6  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
90 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1732  regulatory protein, ArsR  54.64 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44825  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 
100 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  47.37 
 
 
102 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  48 
 
 
100 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 
98 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.44 
 
 
100 aa  90.1  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  41.84 
 
 
103 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  49.4 
 
 
115 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  47.31 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
106 aa  84.3  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6888  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231316  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.75 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  44.21 
 
 
99 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1845  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 
116 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
100 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  31.76 
 
 
135 aa  53.5  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  34.07 
 
 
111 aa  51.6  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 
120 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  34.09 
 
 
112 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  34.09 
 
 
112 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
111 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
115 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4077  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  32.5 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>