More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1894 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 111 aa  232  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  41.49 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  41.49 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  47.47 
 
 		 113 aa  88.2  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  44.94 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  39.8 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  40.82 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  47.06 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  47.06 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  37.36 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  34.62 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  36.19 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  41.25 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  42.68 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  42.53 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  46.03 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  43.75 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 221 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  31 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  39.76 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  38.37 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  44.93 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  39.19 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  44.93 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5692  regulatory protein, ArsR  40.79 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  33.72 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  46.03 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  41.33 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2290  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  43.48 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  36.67 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 305 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>