More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0466 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
108 aa  216  6e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
106 aa  77  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  49.37 
 
 
101 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  41.98 
 
 
91 aa  72  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  41.75 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  43.59 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 
113 aa  70.1  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  34.62 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2722  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000708093  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  36.19 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 
114 aa  67  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
114 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  32.98 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  32.98 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  37.89 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2987  regulatory protein ArsR  41.89 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  46.25 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.61 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  34.07 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  32.32 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  32.67 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
103 aa  63.5  0.0000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  33.68 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  33.66 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
119 aa  62  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 
100 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  30.34 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 
100 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  49.25 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.31 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
95 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1075  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000458748  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 
95 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0052  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.135929  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  37.08 
 
 
113 aa  60.8  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
115 aa  61.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2815  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 
148 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 
113 aa  60.8  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  42.65 
 
 
87 aa  60.8  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3430  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 
91 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3134  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
91 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.339641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3442  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 
91 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1816  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 
91 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98028  normal  0.175921 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3479  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
91 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  45.07 
 
 
141 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>