More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1900 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  53.92 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  45.63 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 100 aa  109  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  47.42 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  46 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  49.43 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 		 111 aa  89.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 		 114 aa  86.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  49.37 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  49.37 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  50.6 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  43.33 
 
 		 134 aa  84.3  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  42.16 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  36.89 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  36.89 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  37.89 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  37.76 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  39.58 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  37.08 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  34.09 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  44.3 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  52.31 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  36.89 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  37.23 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5692  regulatory protein, ArsR  38.83 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073008 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3309  regulatory protein, ArsR  38.71 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0011324  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3028  ArsR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  37.62 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  42.68 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  37.18 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  41.1 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  34.88 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  34.94 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  50 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  33.66 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>