More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2372 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 116 aa  239  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  69.16 
 
 		 111 aa  149  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  55.05 
 
 		 112 aa  125  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  55.05 
 
 		 112 aa  125  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  55.24 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  53.47 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  42.16 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  46.74 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  40.2 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  50.67 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  47.56 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  39.42 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  41.38 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  40.2 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.05 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  38.61 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  47.56 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  45.12 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  36.17 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  47.3 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  39.64 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  41.57 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  56.72 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  46.75 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  46.25 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  43.18 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  40.24 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  43.37 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  46.58 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2641  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.257894  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  40.74 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  47.44 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  47.95 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  49.23 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  46.34 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  38.82 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  45.12 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  29.59 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  39.08 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  47.44 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>