More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0426 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
115 aa  226  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  87.5 
 
 
113 aa  194  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  82.57 
 
 
114 aa  175  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  81.48 
 
 
113 aa  173  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  84.62 
 
 
115 aa  167  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  78.5 
 
 
113 aa  167  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  72.38 
 
 
111 aa  146  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  70.09 
 
 
114 aa  143  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  53.4 
 
 
125 aa  106  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.96 
 
 
109 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  52.83 
 
 
110 aa  103  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  50 
 
 
114 aa  103  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  53.27 
 
 
110 aa  103  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  50.48 
 
 
115 aa  90.1  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  47.12 
 
 
122 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  47.12 
 
 
122 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  47.12 
 
 
122 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  48.45 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5692  regulatory protein, ArsR  45.19 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.073008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3028  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  38.53 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  38.2 
 
 
108 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  39.05 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  39.05 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  46.74 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  38.68 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
116 aa  77  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  41.57 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  47.19 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  32.18 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02300  transcriptional regulator, ArsR family  48.75 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  45.88 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  38.38 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0098  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
122 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  32.98 
 
 
104 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  30.68 
 
 
105 aa  60.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
103 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
106 aa  60.5  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  31.94 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  31.94 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  32.38 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  29.76 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
100 aa  58.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  37.33 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  37.14 
 
 
102 aa  58.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 
111 aa  57.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
122 aa  57.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  35.62 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 
222 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0148  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
91 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
172 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
172 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  41.89 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2815  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  29.7 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  35.96 
 
 
114 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0160  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 
101 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  34.62 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  28.89 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  35 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  36.23 
 
 
102 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
98 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  35.35 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>