More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0620 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
103 aa  209  7.999999999999999e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  52.22 
 
 
104 aa  108  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3309  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0011324  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  46.34 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 
87 aa  72.4  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  44.71 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  44.71 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  41.98 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  40.45 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 
109 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  40.54 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  35.63 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  40.7 
 
 
98 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  44.87 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  39.13 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  37.66 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  35.37 
 
 
266 aa  64.3  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  39.33 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  44.3 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 
106 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  38.75 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
101 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  32.98 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  33.75 
 
 
101 aa  62.8  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 
111 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5478  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.350529  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
109 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  47.06 
 
 
118 aa  62.8  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  38.55 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 
100 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  43.84 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  47.14 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  44.93 
 
 
103 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  41.98 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  41.18 
 
 
117 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>