More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3309 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3309  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 119 aa  246  9e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0011324  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  63.72 
 
 		 115 aa  156  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  48.61 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  38.71 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  46.51 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  44 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  52.31 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  45.98 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  46.91 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  43.06 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  46.38 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  37.65 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  37.8 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  35.14 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  41.43 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  47.06 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  40.23 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  30 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  40.23 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  43.37 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  40 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  39.76 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  36.17 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  38.71 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  39.33 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  41.67 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  39.76 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  39.53 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5478  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.350529  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  48.44 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  36.62 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  36.05 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  43.94 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  41.98 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  39.33 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  41.1 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  46.38 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>