More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0540 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 117 aa  239  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  66.67 
 
 		 138 aa  167  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  69.09 
 
 		 110 aa  164  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  69.09 
 
 		 110 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  61.39 
 
 		 109 aa  130  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  55.45 
 
 		 110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  53.57 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  52.25 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  58.06 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  58.75 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  58.75 
 
 		 116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  58.75 
 
 		 116 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  51.02 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  51.02 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  59.77 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  51.02 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  54.43 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  53.09 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  42.53 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  38.61 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  48.84 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  36.89 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  37.76 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  46.84 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  40.62 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  44.09 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  42.67 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  33.71 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  32.47 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  41.79 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  35.87 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  38.67 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 100 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  41.43 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  44.12 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  39.29 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  41.54 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  36.99 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  35.63 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  35.63 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  34.07 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3309  regulatory protein, ArsR  37.33 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0011324  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  33.75 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  43.75 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 221 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  29.9 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  47.76 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4079  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0764894  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  35 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  47.76 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  38.81 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 95 aa  52  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  38.81 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>