More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1476 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 111 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  73.15 
 
 		 127 aa  174  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  71.17 
 
 		 111 aa  165  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  70 
 
 		 111 aa  160  7e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  65.14 
 
 		 111 aa  149  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  65 
 
 		 113 aa  147  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  66 
 
 		 113 aa  147  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  46.59 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  45.98 
 
 		 109 aa  87.8  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  45.98 
 
 		 109 aa  87.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  51.32 
 
 		 97 aa  84.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  39.05 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  40.43 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  39.56 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  37 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  48.65 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  41.98 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  37.36 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  36.96 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  41.76 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  43.24 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  40.51 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  36.14 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  30.93 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.68 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  30.68 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  30.68 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 99 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  32.58 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  29.55 
 
 		 99 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  35 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2879  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 98 aa  48.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2393  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0242789  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  43.48 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 101 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  31.82 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  31.82 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0051  transcriptional repressor  35.8 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  30.68 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  31.71 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  30.68 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  30.38 
 
 		 95 aa  47.4  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  36.71 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  30.68 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  30.68 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2201  ArsR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00183018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2382  transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  32.43 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  32.43 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  32.43 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3309  regulatory protein, ArsR  45.1 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0011324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>