More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001410 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  100 
 
 		 113 aa  233  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  81.42 
 
 		 113 aa  197  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  43.82 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  48.15 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  48.68 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  47.22 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  48.05 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  44.94 
 
 		 89 aa  70.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  48.68 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  44.3 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  37.37 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  39.33 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  39.56 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  44.58 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  40.22 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  40.22 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  37.36 
 
 		 336 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 297 aa  57.8  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  33.64 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  38.81 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  34.41 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  38.81 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  35.87 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  43.42 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  29.91 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 99 aa  52  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  35.11 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2283  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 116 aa  52  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  31.63 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  34.41 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  34.78 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1004  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 341 aa  50.8  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000308504  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  36.71 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  30.21 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.34 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  34.34 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 317 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  36.49 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  37.84 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  37.84 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  40.54 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>