More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0974 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
116 aa  230  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  54.95 
 
 
114 aa  102  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  50.54 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  53.25 
 
 
146 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  49.41 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  49.41 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  48.05 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
117 aa  68.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  42.68 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  39.77 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  51.39 
 
 
111 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  43.9 
 
 
120 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  37.66 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  36.47 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 
118 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
103 aa  60.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  40 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  39.67 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  35.4 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  40.74 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  35.56 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  45.24 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
126 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  31.4 
 
 
109 aa  57.4  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  32.91 
 
 
90 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
112 aa  57  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
90 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  36.19 
 
 
122 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  42.11 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
116 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  28.57 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
115 aa  54.3  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  45.76 
 
 
109 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  36.78 
 
 
123 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
121 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
127 aa  52.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  35.56 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  40.62 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  35.44 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 
109 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
109 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  32.8 
 
 
125 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 
109 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  30.49 
 
 
100 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  34.94 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  32.32 
 
 
112 aa  50.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  36.78 
 
 
131 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  50.98 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>