More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5239 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  71.25 
 
 		 93 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 125 aa  83.6  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  47.67 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  46.34 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  53.75 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  50.63 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  52.56 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  51.85 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  50.57 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  49.44 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  47.73 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 183 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  54.41 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  48.75 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  48.65 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  48.65 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  44.58 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1390  transcriptional regulator, ArsR family  48.65 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000534285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  46.99 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  47.44 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  44.71 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  47.44 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  45.57 
 
 		 120 aa  67  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.29 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.29 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  41.3 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.84 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  43.68 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.29 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  44.29 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  42.53 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.29 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.29 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.29 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  46.99 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  44.29 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 		 347 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  42.5 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  32.1 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  34.12 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.1 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.1 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  37.97 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  46.88 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>