More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1216 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 106 aa  216  7e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  54.84 
 
 		 108 aa  114  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  47.42 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  48.84 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  50.62 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  51.06 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  51.43 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  39.58 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  39.58 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  52.11 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  46.05 
 
 		 93 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  43.75 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  42.17 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  39.44 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  45.74 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  46.48 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  46.48 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  37.93 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  44.3 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  49.25 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  47.44 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  43.02 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  50.75 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  51.56 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1708  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00199719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  37.97 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1301  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  38.83 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  40.7 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  40.7 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  43.59 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 95 aa  67  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  38.38 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  43.9 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  43.9 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5692  regulatory protein, ArsR  39.29 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073008 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>