More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3347 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 120 aa  236  5.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  65.66 
 
 		 116 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  56.25 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  61.46 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  56.44 
 
 		 121 aa  121  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  61.11 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  71.43 
 
 		 95 aa  119  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  59.14 
 
 		 116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  55.65 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  54.63 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  49.07 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  59.78 
 
 		 124 aa  110  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  54.64 
 
 		 131 aa  110  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  54.17 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  56.47 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  57.89 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  50.51 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  49.48 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  43.86 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  53.41 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  46.67 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  51.76 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  40.21 
 
 		 336 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  45.83 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  48.84 
 
 		 183 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  46.36 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  47.87 
 
 		 109 aa  94  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  47.92 
 
 		 122 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  40.37 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  49.37 
 
 		 347 aa  91.7  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 		 115 aa  90.9  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  43.96 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 337 aa  90.1  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 		 349 aa  89  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  48.75 
 
 		 337 aa  87  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 68 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  38.74 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.51 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  46.05 
 
 		 340 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  37.5 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  40.19 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  43.16 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 341 aa  71.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  37.5 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 341 aa  70.9  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  37.37 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  32.18 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  37.93 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  45.07 
 
 		 341 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  36.9 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  47.83 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0817  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  36.78 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  38.32 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  29.89 
 
 		 95 aa  67  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  29.55 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  34.04 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 90 aa  66.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>