More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26420 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
109 aa  220  6e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  59.3 
 
 
129 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  61.8 
 
 
127 aa  105  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  54.08 
 
 
125 aa  103  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  58.7 
 
 
124 aa  103  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  59.77 
 
 
127 aa  102  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  54.46 
 
 
127 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  53.61 
 
 
131 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  49.04 
 
 
116 aa  101  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  56.32 
 
 
125 aa  101  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  54.08 
 
 
136 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  54.55 
 
 
127 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  56.04 
 
 
116 aa  99  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  55.17 
 
 
125 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  56.1 
 
 
116 aa  99.4  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
124 aa  97.1  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  55.84 
 
 
95 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  51.65 
 
 
125 aa  94.4  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  47.87 
 
 
120 aa  94  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  57.69 
 
 
108 aa  93.2  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  48.91 
 
 
121 aa  92.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 
121 aa  92.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  51.28 
 
 
118 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  51.32 
 
 
349 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  48.31 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  56.06 
 
 
347 aa  88.6  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
112 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  49.43 
 
 
120 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  53.25 
 
 
183 aa  89  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  57.14 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  51.32 
 
 
123 aa  87.8  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  44.32 
 
 
120 aa  86.7  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  53.73 
 
 
336 aa  86.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 
127 aa  85.9  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
125 aa  85.9  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.28 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
126 aa  84.3  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
123 aa  84  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  50.7 
 
 
120 aa  84  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  47.19 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  49.35 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  75.51 
 
 
68 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  45.57 
 
 
104 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
119 aa  77  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
108 aa  77  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
118 aa  76.6  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  52.46 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  41.05 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  46.75 
 
 
103 aa  73.6  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  51.32 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  37.97 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  37.97 
 
 
115 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  37.97 
 
 
115 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2432  transcriptional regulator, ArsR family  47.95 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00680056  normal  0.462104 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  41.79 
 
 
101 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  38.82 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
101 aa  67  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  38.81 
 
 
101 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  38.81 
 
 
101 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  38.81 
 
 
101 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  38.81 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  38.81 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  38.81 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  38.81 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  40.3 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  43.66 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  42.68 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>