More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3423 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 119 aa  236  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  64.66 
 
 		 125 aa  153  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  62.07 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  63.11 
 
 		 113 aa  137  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  59.82 
 
 		 123 aa  137  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 		 112 aa  136  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  68.09 
 
 		 104 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  66.67 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  54.95 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 		 115 aa  127  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  54.78 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  59.79 
 
 		 183 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  58.59 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  52.99 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  53.98 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  63.55 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  59.57 
 
 		 105 aa  116  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  55.86 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  58.89 
 
 		 120 aa  113  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  57.78 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  55.79 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  55.79 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  55.79 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  55.21 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  55 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  58.95 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  50.47 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  54.26 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  57.89 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  51.49 
 
 		 116 aa  106  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  49.15 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  55.32 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  54.17 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  56.1 
 
 		 95 aa  100  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  51.46 
 
 		 127 aa  100  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  54.44 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  60.26 
 
 		 337 aa  98.2  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  49.5 
 
 		 137 aa  98.2  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  54.43 
 
 		 347 aa  97.1  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  45.37 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  54.43 
 
 		 349 aa  95.5  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  46.67 
 
 		 336 aa  94.7  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 120 aa  94.4  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  47.12 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 120 aa  92.8  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  51.85 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  61.11 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  47.13 
 
 		 337 aa  91.3  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  48.51 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  52.05 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.71 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  40 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  51.9 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  45.95 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  44.74 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  50.6 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  53.75 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  50.63 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  51.39 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  58.21 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  50.62 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 114 aa  76.6  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  55.71 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.4 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  41.56 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  41.56 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 68 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1112  regulatory protein, ArsR  45.16 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  40.26 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  42.72 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  47.89 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  40.78 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 258 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  47.89 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  47.89 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>