More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1390 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1390  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 137 aa  273  5e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000534285  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3088  regulatory protein, ArsR  35.4 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6743  transcriptional regulator, ArsR family  37.72 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.661837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  44.3 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  43.21 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  40.57 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  36.61 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 337 aa  73.6  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  40.4 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  41.51 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  35.51 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.27 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  41.03 
 
 		 336 aa  70.5  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  48.65 
 
 		 97 aa  70.1  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  38.55 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  46.51 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  34.91 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  38.82 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  34.88 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  45.21 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  41.79 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  46.97 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  46.97 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  46.43 
 
 		 349 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  34.31 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1608  transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  48.68 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  43.66 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  42.25 
 
 		 113 aa  67  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  46.88 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.35 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  47.22 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  34.74 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 342 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  30.61 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 339 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  33.68 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.15 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  30.61 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  30.61 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  30.61 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 349 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.88 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  29 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  30.61 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 354 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  31.82 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  43.94 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  31.82 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  45.71 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.08 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.08 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.08 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.08 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1404  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>