More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6743 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013731  Slin_6743  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.661837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3088  regulatory protein, ArsR  50.91 
 
 
124 aa  113  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1390  transcriptional regulator, ArsR family  37.72 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000534285  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  37.86 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  37.86 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  38.53 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  35.09 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  41.86 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  41.86 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  48.53 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  41.86 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  44.58 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  45.35 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  45.35 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  38.14 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  45.59 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  37.72 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  34.31 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  43.24 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  40.85 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  43.24 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  31.53 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  41.57 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 
117 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 
122 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  45.59 
 
 
121 aa  62  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  37.23 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
122 aa  61.6  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 
118 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0936  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 
103 aa  61.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00366082  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  43.04 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 
135 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
124 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  38.82 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2281  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
120 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  38.3 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  46.03 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 
354 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  40.45 
 
 
349 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  44.93 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1931  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
124 aa  57.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
297 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  35.37 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  40.28 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
342 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 
114 aa  57  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
98 aa  57  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
120 aa  57  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>